朱由检首先抛出了新军的编制构想，发觉在座的几人并没有反对的意思之后，他便继续往下说道：“总参谋部要协助建立新军的后勤部门，并编制一份可以规范使用的后勤条例出来。”
“陛下，这条例是什么意思？”茅元仪听到这么多新名词之后，终于忍不住发问道。
“条例就是：根据某些具体事项而作出的，可以参照执行的范例，一经制定实施之后，没有朕或是兵部的允许，就不得擅自更改、终止，对于违反者以军纪处置。”朱由检看着他毫不迟疑的说道。
边上的袁崇焕顿时有了一丝明悟，“崇祯并不是一时起意的瞎折腾，而是早就对军制变革进行过深入思考了。只不过，正如崇祯所言，他不过是一名不谙世事的深宫少年，到底是谁在皇帝背后出谋划策？”
不仅仅是袁崇焕想到了，鹿善继同样也明白了过来。两人忧心忡忡的互相对视了一眼，就获悉了对方的此刻的心思。
两人现在的想法就是，在皇帝身边的这个谋臣没有暴露之前，先静观其变。否则贸然出手反对崇祯对于军制变革的想法，恐怕下一步就无法了解崇祯真正想要做什么了。
看着始终没什么反应的几位文官，朱由检继续试探着说了下去：“总参谋部还要协助建立军法官系统，并制定军中的各种条令，比如战斗条令、内务条令、队列条令等。
总而言之，当一位平民应征ｊｉｎｒｕ了军营之后，他的一举一动都必须在条令的指导下生活、作息、战斗，决不允许出现在军营内有平民式样的放任自由。”
孙承宗脸色变了变，他终于开口反对道：“陛下，以严刑峻法治军，自然是古往今来强军的第一要务。
但是陛下这想法是不是有些闭门造车了，臣见过戚金率领的戚家军，彼虽然治军严苛，行伍之间秩序井然。但是也未闻闲暇之时，也要以军令管束军士的。
军营之中本就有十七条禁律五十四斩，再加上陛下所言的如许多条令，臣恐怕军士尚未上阵，已经毫无斗志了。
俗语有云，文武之道在于一张一弛。正因为战时军纪森严，所以平日里才应该稍稍予军士以休息，不可逼迫军士过度啊，陛下。”
鹿善继也从旁声援道：“陛下，孙大学士说的不错，军中大多数人都是有家室之人。战时出征自然当严军纪，禁止百姓擅入军营。
但是平日驻扎老营之时，还要隔离军士同亲人相见，恐怕军士们会鼓噪起来啊…”
冷静的听完了几位文官的意见，朱由检又依次询问了三位武官。对于这种关系到切身利益的事上，俞咨皋、尤世威、吴怀自然也是反对的。
朱由检询问完之后，便平静的说道：“孙先生说的十七条禁律五十四斩，的确是严酷了一些，朕以为可以重新进行修订。
此外军中刑罚不能以杀人了事，制定军律的意义在于约束军人的行动，而不是为了杀军人。
为了避免军中主官随意处罚军士，今后除了军法官之外，任何人不得执行军法。主官可以要求军法官进行案件复核，但是无权干涉军法官执行军纪。
军法官不得处置同级别的军事主官，但是可以向上一级军法官进行汇报。此外各军总兵一级的武官，除五军都督府下辖的军事法庭外，任何人都无权对其进行审判。”
崇祯的说法，倒是让俞咨皋等武官轻松了不少。再以往就算是总兵，遇到了拿着尚方宝剑的总督、巡抚，也要胆颤心惊的。因为这些文人大帅，最喜欢的就是拿桀骜不驯的武将头颅，来震慑武人竖立自己在军中的威望。
在这种生命都有可能不保的状况下，有那个武将敢在军事会议上，反对几个读书人拍脑袋想出来的计划呢？
于是战前的军略会议，往往就成了总督、巡抚的作战方案布置会议，甚至于有些武将根本不明白自己究竟是去做什么的，他们只记住了，某月某日之前必须赶到某地，否则就是失期之罪。
现在按照皇帝的变革，虽然军官失去了对下属军士随意处罚的权力。但是同样的，军官们也不必再畏惧上官及文官大帅，找借口随意处置他们了。
三名武官顿时转为支持崇祯对于军纪处罚权力的改革了，孙承宗等人则对此不以为然，毕竟军纪这种事，永远不会加诸于文官身上。
“制定条令的目的，是要让一个平民在最短的时间，成为一名按照命令行事的军人。朕不相信，一个平时连军令都不愿意遵守的人，上了战场之后，会听从将领的指挥，同敌人去搏杀。
朕所以要把军人和百姓隔离，就是要他们从ｊｉｎｒｕ军营这一刻开始，养成按照命令行事的习惯。只有这样，军队上了战场之后，才不会一哄而散。